Γεννημένος στις 28 Ιουλίου 1992 στο Βέλγιο, ο Βίκτωρ Κλωναρίδης ξεκίνησε την επαγγελματική του καριέρα από την ΑΕΚ.

Το καλοκαίρι του 2012 πήρε μεταγραφή για τη Λιλ, η οποία -έξι μήνες αργότερα- τον παραχώρησε με τη μορφή δανεισμού στη Μουσκρόν.

Ακολούθως, επέστρεψε στην Ελλάδα για λογαριασμό του Παναθηναϊκού, στον οποίο αγωνίστηκε για τρεισήμισι χρόνια σε δύο θητείες. Με τους πράσινους πανηγύρισε την κατάκτηση του Κυπέλλου Ελλάδας το 2014, όντας εκ των πρωταγωνιστών στην πορεία της ομάδας, όπως αποδεικνύει ο αριθμός των 123 συμμετοχών με απολογισμό τα 29 γκολ και τις 18 ασίστ. Ανάμεσα στις δύο περιόδους που φόρεσε τη φανέλα του Παναθηναϊκού, αγωνίστηκε για έξι μήνες στη Λανς.

Το καλοκαίρι του 2017 ξεκίνησε η δεύτερη θητεία του στην ΑΕΚ, με την οποία έφτασε ως την κατάκτηση του Πρωταθλήματος μερικούς μήνες αργότερα και τη συμμετοχή στους ομίλους του Champions League του 2018/19. Μετά από μια σπουδαία τριετία με 72 συμμετοχές σε Πρωτάθλημα, Κύπελλο Ελλάδας, Champions και Europa League, πήρε μεταγραφή για τον ΑΠΟΕΛ (2020/21), με τον οποίο είχε 7 γκολ και 7 ασίστ σε 39 συμμετοχές σε όλες τις διοργανώσεις.

Το 2021 επέστρεψε στην Ελλάδα για τον Ατρόμητο, του οποίου αποτέλεσε βασικό στέλεχος για δύο χρόνια (46 συμμετοχές με 4 γκολ και 8 ασίστ σε Super League και Κύπελλο Ελλάδας).

Το περασμένο καλοκαίρι πήρε την απόφαση να αγωνιστεί στην Τουρκία με την Ουμρανίγεσπορ, με την οποία είχε 12 συμμετοχές (2 γκολ, 1 ασίστ) σε Πρωτάθλημα και Κύπελλο.